Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP19O94966 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP19O94966 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
USP19O94966 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP19O94966 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP19O94966 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
USP19O94966 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP19O94966 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP19O94966 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP19O94966 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP19O94966 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP19O94966 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP19O94966 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP19O94966 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP19O94966 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms