Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG12O94817 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG12O94817 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms