Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF40AO75400 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF40AO75400 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF40AO75400 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms