Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms