Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSCO60682 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSCO60682 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSCO60682 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSCO60682 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSCO60682 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSCO60682 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSCO60682 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSCO60682 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSCO60682 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSCO60682 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSCO60682 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms