Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms