Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms