Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TREHO43280 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREHO43280 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREHO43280 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREHO43280 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREHO43280 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TREHO43280 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREHO43280 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREHO43280 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREHO43280 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREHO43280 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms