Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms