Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms