Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF10O15013 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF10O15013 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF10O15013 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms