Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms