Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QKU1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QKU1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QKU1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QKU1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QKU1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QKU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QKU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QKU1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QKU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms