Protein–RNA interactions for Protein: F6UB75

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F6UB75 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F6UB75 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F6UB75 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F6UB75 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F6UB75 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F6UB75 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms