Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms