Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN2A8MW95 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms