Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms