Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIPT2A6NK58 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms