Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms