Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC144AA2RUR9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms