Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms