Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms