Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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