Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYQ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYQ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYQ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYQ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.9 ms