Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRPRBQ9Y5M8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRBQ9Y5M8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms