Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN16Q9Y5I7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms