Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms