Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARP1Q9Y4F1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms