Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms