Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms