Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC47.51■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.2
NISCHQ9Y2I1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC47.48■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC47.44■■■■■ 5.19
NISCHQ9Y2I1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC47.44■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC47.44■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC47.44■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC47.43■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
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