Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGTPBP1Q9UPW5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms