Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms