Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNRGQ9UMZ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNRGQ9UMZ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms