Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms