Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC7AQ9ULT0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC7AQ9ULT0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms