Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRTO4Q9UKD2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRTO4Q9UKD2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms