Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms