Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA1Q9UIW2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms