Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPXQ9UHP9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms