Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms