Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms