Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms