Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms