Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms