Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP2BPQ9P2M1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms