Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CCDC180Q9P1Z9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms