Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4Q9P0V3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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