Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKIRAS2Q9NYR9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms