Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR7Q9NYK1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR7Q9NYK1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms